Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms