Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a3Q9QZS0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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