Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp21Q9QZL6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms