Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms