Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms