Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lsm4Q9QXA5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms