Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms