Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gde1Q9JL56 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms