Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup50Q9JIH2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms