Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn12Q9ET43 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn12Q9ET43 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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