Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms