Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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