Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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