Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms