Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms