Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Barx1Q9ER42 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms