Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms