Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms