Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms