Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp12Q9D9M2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms