Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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