Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms