Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms