Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms