Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp4cQ9D7F7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms