Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tube1Q9D6T1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms