Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms