Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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