Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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