Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc71Q9D3W5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc71Q9D3W5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms