Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms