Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt20Q9D312 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms