Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms