Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snapc3Q9D2C9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snapc3Q9D2C9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snapc3Q9D2C9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snapc3Q9D2C9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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