Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms