Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gins3Q9CY94 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms