Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx7Q9CY18 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx7Q9CY18 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx7Q9CY18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx7Q9CY18 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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