Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms