Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms