Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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