Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms