Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ddx28Q9CWT6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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