Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms