Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb2bQ9CWF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb2bQ9CWF2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms