Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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