Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dis3Q9CSH3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms