Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms