Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Filip1Q9CS72 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms