Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms