Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms